Органы государственной и муниципальной власти

– Административно-политическое управление

Органы юстиции и судебные органы Томской области, г. Томск, сентябрь 1944 г. — 1 октября 1956 г.; 25 февраля 1971 г. — 17 декабря 2004 г. (Органы юстиции и судебные органы Томской области)
Ф. 5954, 2230 ед.хр.; 1938-2004 гг.

Главное управление по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям Томской области, г. Томск, 5 февраля 1961 г. — 31 марта 2008 г. (Главное управление по делам ГО и ЧС Томской области)
Ф. 5958, 207 ед.хр.; 1957-2008 гг.

Учреждение юстиции по государственной регистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним на территории Томской области, г. Томск, 14 мая 1998 г. — 31 декабря 2004 г. (Учреждение юстиции по госрегистрации прав на недвижимое имущество и сделок с ним на территории Томской области)
Ф. 5952, 206 ед.хр.; 1998-2004 гг.

– Политические объединения постсоветского времени

Колпашевский городской комитет Российского союза молодежи, г. Колпашево Томской области, 17 марта 1992 г. — [декабрь] 1993 г. (Колпашевский горком РСМ)
Ф. 5637, 11 ед.хр.; 1990-1993 гг.

Томская областная организация Всероссийского общественно-политического движения «Наш Дом — Россия», г. Томск Томской области, 29 мая 1995 г. — [декабрь 2000 г.] (Томская областная организация НДР)
Ф. 5670, 161 ед.хр.; 1995-2000 гг.

Томское отделение Общероссийской общественной организации «Политическая партия «Демократический выбор России», г. Томск Томской области, 30 июня 1994 г. — 20 июня 2001 г. (Томское отделение ДВР)
Ф. 5754, 86 ед.хр.; 1994-2001 гг.

Томское региональное отделение общероссийской политической общественной организации «Отечество», г. Томск Томской области, 14 ноября 1998 г. — 25 февраля 2002 г. (Томское региональное отделение ОПОО «Отечество»)
Ф. 5771, 66 ед.хр.; 1998-2002 гг.

Томское региональное отделение Политической партии «Союз правых сил», г. Томск, 30 сентября 2000 г. — … (Томское региональное отделение ПП «СПС»)
Ф. 5859, 46 ед.хр.; 1999-2004 гг.

Томское областное отделение Российского политического общественного движения «Союз реалистов», г. Томск, 19 ноября 1996 г. — 5 февраля 2001 г. (ТОО РПОД «Союз реалистов»)
Ф. 5860, 21 ед.хр.; 1996-2001 гг.

Органы власти и управления

Областное государственное учреждение «Томскалкоголь-контроль», г. Томск, 1 сентября 1998 г. — 28 ноября 2002 г. (ОГУ «Томскалкогольконтроль»)
Ф. 5780, 116 ед.хр.; 1998-2002 гг.

Некоммерческое партнерство «Томская региональная гильдия профессионального антикризисного управления», г. Томск Томской области, 30 марта 2000 — 11 декабря 2003 г. (НП «Томская региональная гильдия профессионального антикризисного управления»)
Ф. 5799, 37 ед.хр.; 2000-2003 гг.

Территориальный орган Федеральной службы России по финансовому оздоровлению и банкротству в Томской области, г. Томск, 4 марта 1994 г. — 24 марта 2004 г. (Территориальный орган Федеральной службы России по финансовому оздоровлению и банкротству в Томской области)
Ф. 5808, 56 ед.хр.; 1994-2004 гг.

Федеральное государственное учреждение «Энергетическая инспекция государственного энергетического надзора по Томской области» Федеральной службы по экологическому, технологическому и атомному надзору Правительства Российской Федерации («Томскгосэнергонадзор»), г. Томск Томской области, 31 октября 1996 г. — 7 декабря 2004 г. («Томскгосэнергонадзор»)
Ф. 5816, 254 ед.хр.; 1996-2004 гг.

Управление Государственной хлебной инспекции при Правительстве Российской Федерации по Томской области, г. Томск, 12 мая 1994 г. — 27 марта 2007 г. (Томское областное управление Росгосхлебинспекции)
Ф. 5898, 75 ед.хр.; 1994-2011 гг.

Томский филиал Федерального государственного учреждения «Федеральный лицензионный центр при Росстрое», г. Томск, 9 июня 2001 г. — 18 февраля 2010 г. (Томский филиал ФГУ «Федеральный лицензионный центр» )
Ф. 5976, 23 ед.хр.; 2001-2010 гг.

Управление Федерального агентства кадастра объектов недвижимости по Томской области, г. Томск, 24 декабря 1990 г. — [апрель] 2010 г. (Управление Роснедвижимости по Томской области)
Ф. 5990, 399 ед.хр.; 1991-2010 гг.

Территориальное управление Федерального агентства по управлению особыми экономическими зонами по Томской области, г. Томск, 20 января 2006 г. — 16 декабря 2010 г. (Территориальное управление Федерального агентства по управлению ОЭЗ по Томской области)
Ф. 6026, 53 ед.хр.; 2006-2010 гг.

Областное государственное бюджетное специализированное учреждение «Фонд государственного имущества Томской области» Департамента по управлению государственной собственностью, г. Томск Томской области, 17 января 1992 г. – 05 июня 2017 г. (ОГБСУ «ФГИ ТО»)
Ф. 6238, 185 ед. хр., 1992–2017 гг., оп.  2.