Муниципальное предприятие «Пассажирское автотранспортное предприятие № 1», г. Томск, сентябрь 1930 г. — (МП «ПАТП — 1»)
Ф. 5649, 562 ед.хр.; 1931-1998 гг.
Автоколонна № 1975 Томского территориального производственного объединения автомобильного транспорта «Томскавтотранс» и Открытое акционерное общество «Автоколонна 1975″, г. Томск, [июль 1954 г.] — 21 марта 2003 г. (Автоколонна 1975)
Ф. 5747, 1821 ед.хр.; 1948-2002 гг.
Автотранспортное предприятие Томского научного центра Сибирского отделения Российской Академии наук, г. Томск Томской области, 1 января 1985 г. — 16 июня 2001 г. (АТП ТНЦ СО РАН)
Ф. 5749, 469 ед.хр.; 1985-2001 гг.
Томское муниципальное пассажирское автотранспортное предприятие № 2 Администрации г. Томска, г. Томск Томской области, 15 марта 1985 г. — 17 марта 2003 г. (Томское ПАТП-2)
Ф. 5783, 2683 ед.хр.; 1985-2003 гг.
Автотранспортное предприятие «Томскагропромтранс» Агропромышленного комитета Томского облисполкома и Открытое акционерное общество (ОАО) «Томскдортранс», г. Томск, 16 января 1968 г. — 18 ноября 2004 г. (Автотранспортное предприятие «Томскагропромтранс» и ОАО «Томскдортранс»)
Ф. 5798, 1816 ед.хр.; 1968-2003 гг.
Автобаза Томского специализированного треста транспортного строительства «Томсктрансстрой» и Автобаза открытого акционерного общества «Томсктрансстрой», г. Томск, 1 января 1969 г. — 21 июля 1999 г. (Автобаза «Томсктрансстроя»)
Ф. 5833, 269 ед.хр.; 1969-1999 гг.
Открытое акционерное общество «Транспортная компания «Сибирские Афины»», г. Томск, 31 октября 1996 г. — 15 декабря 2005 г. (ОАО «ТК «Сибирские Афины»)
Ф. 5852, 33 ед.хр.; 1996-2002 гг.
Общество с ограниченной ответственностью (ООО) «Автомобилист», г. Томск, 20 августа 2003 г. — [октябрь] 2006 г. (ООО «Автомобилист»)
Ф. 5887, 131 ед.хр.; 2003-2006 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «ГорАвтоТранс» (Горавтотранс), г. Томск, 4 июля 2004 г. — [декабрь] 2009 г. (ООО «ГорАвтоТранс»)
Ф. 5971, 52 ед.хр.; 2004-2009 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «ТрансАвто», г. Томск, 5 мая 2005 г. — 19 августа 2009 г. (ООО «ТрансАвто»)
Ф. 5988, 23 ед.хр.; 2005-2009 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Транспортная компания «РУ.САК», г. Томск, 25 мая 2005 г. — [2010 г.] (ООО «Транспортная компания «РУ.САК»)
Ф. 5995, 38 ед.хр.; 2005-2010 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Томская транспортная компания», г. Томск, 31 марта 2004 г. — 8 июня 2010 г. (ООО «ТомТраК»)
Ф. 6041, 38 ед.хр.; 2004-2010 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Транспортно-эксплуатационная компания», г. Томск, 18 августа 2006 г. — 8 июня 2010 г. (ООО «Транспортно-эксплуатационная компания» (ООО «ТЭК»)
Ф. 6044, 21 ед.хр.; 2006-2010 гг.
Пассажирское вагонное депо Томск открытого акционерного общества «Российские железные дороги», г. Томск, 1 июля 2007 г. – …
Ф. 6065, 1000 ед. хр.; 2007-2010 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Специальное транспортное управление», г. Томск, 22 июня 2004 г. — 29 июня 2011 г. — 29 июня 2011 г. (ООО «Специальное транспортное управление»)
Ф. 6100, 130 ед.хр.; 2004-2011 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Томское транспортное управление», г. Томск, п. Предтеченск, 18 апреля 2006 г. — 20 июня 2012 г. (ООО «Томское транспортное управление»)
Ф. 6103, 36 ед.хр.; 2006-2012 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Управление специальной техники», г. Томск, 3 апреля 2002 г. – 31 октября 2011 г. (ООО «Управление специальной техники»)
Ф. 6104, 59 ед.хр.; 2002-2011 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Центр транспортных перевозок», г. Томск, п. Предтеченск, 4 октября 2006 г. — 2 декабря 2011 г. (ООО «Центр транспортных перевозок»)
Ф. 6105, 10 ед.хр.; 2006-2011 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Транспортные системы», г. Томск, 27 декабря 2007 г. — [17 декабря 2012 г.] (ООО «Транспортные системы»)
Ф. 6113, 13 ед.хр.; 2007-2011 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «РемАвтоМаш», г. Томск, 08 августа 2006 г. – 31 мая 2013 г. (ООО «РемАвтоМаш»)
Ф. 6163, 50 ед.хр.; 2006-2014 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «РемСДМ», г. Томск, 08 августа 2006 г. – 13 января 2014 г. (ООО «РемСДМ»)
Ф.6164, 47 ед. хр.; 2006-2014 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Автомобилист», с. Молчаново Томской области, 08 сентября 2003 г. — 27 мая 2014 г. (ООО «Автомобилист»)
Ф. 6169, 50 ед.хр.; 2003-2014 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Молчановоспецтех», с. Молчаново Томской области, 16 сентября 2003 г. — 27 мая 2014 г. (ООО «Молчановоспецтех»)
Ф. 6170, 50 ед.хр.; 2003-2014 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Строительная компания «Молчановодорстрой», с. Молчаново Томской области, 10 декабря 2002 г. — 27 мая 2014 г. (ООО «СК «Молчановодорстрой»)
Ф. 6171, 55 ед.хр.; 2002-2014 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Сибтранс», с. Молчаново Томской области, 10 июня 2003 г. — 27 мая 2014 г. (ООО «Сибтранс»)
Ф. 6172, 12 ед.хр.; 2003-2014 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Стройлогистика», пос. Копылово Томского района Томской области, 23 июля 2010 г. – 21 марта 2014 г. (ООО «Стройлогистика»)
Ф. 6192, 32 ед.хр.; 2010-2014 гг.
Производственное автотранспортное объединение «Томскагростройтранс» Государственно-кооперативного объединения по строительству «Томскагропромстрой» и открытое акционерное общество «Нива», г. Томск Томской области, 14 августа 1968 г. – 29 ноября 2005 г. (ПАТО «Томскагростройтранс» и ОАО «Нива»)
Ф. 6200, 174 ед.хр.; 1966-2005 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Норд» (ООО «Норд»), г. Томск Томской области, 09 февраля 2010 г. – [26 августа 2015 г.]
Ф. 6203, 8 ед.хр.; 2010, 2012, 2015 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «СТУ-Траст» (ООО «СТУ-Траст»), г. Томск Томской области, 05 ноября 2008 г. – 23 августа 2013 г.
Ф. 6208, 97 ед.хр.; 2008–2013 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Управление механизации Томска», г. Томск Томской области, 27 августа 2008 г. – 18 ноября 2010 г. (ООО «УМТ»)
Ф. 6259, 10 ед.хр.; 2008-2010 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Грузоперевозчик», г. Томск Томской области, 08 декабря 2004 г. – 31 января 2008 г. (ООО «Грузоперевозчик»).
Ф. 6264, 21 ед.хр.; 2004-2008 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «МЭТР», г. Томск Томской области, 03 марта 2006 г. – 25 февраля 2013 г. (ООО «МЭТР»)
Ф. 6268, 33 ед.хр.; 2006-2013 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Агат», г. Томск Томской области, 24 июня 2005 г. – 02 февраля 2015 г. (ООО «Агат»).
Ф. 6284, 34 ед.хр.; 2005-2013 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Сбыт» (ООО «Сбыт»).
Ф. 6287, 10 ед.хр.; 2004-2006 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Гранит», г. Томск Томской области, 15 ноября 2004 г. – 30 мая 2017 г. (ООО «Гранит»)
Ф. 6301, 11 ед.хр.; 2004-2006 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Пегас», г. Томск Томской области, 20 июля 2005 г. – 22 августа 2016 г. (ООО «Пегас»)
Ф. 6302, 13 ед.хр.; 2005-2008 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Вираж», г. Томск Томской области, 17 июля 2006 г. – 24 июля 2009 г. (ООО «Вираж»)
Ф. 6309, 8 ед.хр., 2006–2007 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Мехмонтаж», г. Томск Томской области, 20 декабря 2004 г. – 02 июля 2020 г. (ООО «Мехмонтаж»)
Ф. 6324, 28 ед.хр.; 2004-2012, 2020 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Горсети-Авто», г. Томск Томской области, 21 марта 2007 г. – 08 декабря 2010 г. (ООО «Горсети-Авто»)
Ф. 6328, 5 ед.хр.; 2008-2010 гг.
Общество с ограниченной ответственностью «Транспортная компания Альянс», г. Томск Томской области, 25 июля 2016 г. – 24 ноября 2020 г. (ООО «ТК Альянс»)
Ф.6371, 85 ед.хр.; 2016-2020 гг., оп. 2
Общество с ограниченной ответственностью «Интербалк Терминал», г. Томск Томской области, 06 сентября 2011 г. – [01 сентября 2022 г.] (ООО «Интербалк Терминал»)
Ф.6372, 90 ед.хр.; 2011-2022 гг., оп. 2